Ya en su regreso, la temporada continua por buen camino, pero termina siendo eliminado de la Copa del Rey y la Liga de Campeones en semifinales. El 17 de junio, el Barcelona le informó a la AFA que no cedería a Messi para los Juegos Olímpicos de Pekín por considerar que, al no ser una competición oficial de la FIFA, la reglamentación no lo obligaba y porque quería contar con «una de las piezas claves del equipo» en las preliminares de la Liga de Campeones.
