En la dicha temporada consiguió mantenerse pero en la temporada 2006-07 perdió la categoría al finalizar 19º, pese a contar con una de las mejores generaciones de futbolistas que dio la cantera, con hombres como Juan Mata, Roberto Soldado o Álvaro Negredo. Somos los de Independiente de pierna fuerte y templada guapos para una jornada dignos de un team muy valiente siempre luchamos unidos sin llamarnos temerarios saludamos al contrario vencedores o vencidos luchamos sin ambiciones no tenemos avaricia nada más que la malicia tenemos en ocasiones pondremos siempre altanera nuestra divisa granate y en medio de un gran combate flameara nuestra bandera y a de gritar el que pueda siguiendo nuestra corriente urras al independiente del pueblo de Avellaneda urras al independiente del pueblo de Avellaneda urras al independiente del pueblo de Avellaneda.
