En torneos Masters 1000 disputaron catorce encuentros, liderando Nadal por 12-2 en los enfrentamientos particulares. En torneos Masters 1000 lidera Nadal sus enfrentamientos particulares por 13-2, destacando la final del Masters 1000 de Madrid en 2013 que venció el español. El español domina por 3-1 en Grand Slam, habiendo vencido una vez en el Abierto de Australia en 2007 y dos veces en Roland Garros, una en 2013 y la otra en la final de 2017. Mientras que el suizo venció en la final del Abierto de Australia en 2014, rompiendo sorprendentemente y para asombro del mundo entero, una racha de 12 derrotas consecutivas ante el español en su primera final de Grand Slam.
